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什么是凝膠電泳
那么下面為大家簡(jiǎn)單介紹一下關(guān)于什么是凝膠電泳:
電泳是實(shí)驗室中常用的一種技術(shù),用于根據大小分離帶電分子,例如DNA。
凝膠電泳是實(shí)驗室中常用的一種技術(shù),用于分離帶電分子,例如DNA ,RNA 和蛋白質(zhì)。根據它們的大小。
當電流通過(guò)凝膠時(shí),帶電分子穿過(guò)凝膠。
在凝膠上施加電流,以使凝膠的一端帶正電荷,而另一端帶負電荷。
帶電分子的運動(dòng)稱(chēng)為遷移。分子向相反電荷遷移。因此,帶負電荷的分子將被拉向正末端(相反的方向吸引?。?。
凝膠由可滲透的基質(zhì)(有點(diǎn)像篩子)組成,當電流通過(guò)時(shí),分子可以穿過(guò)該基質(zhì)。
較小的分子在凝膠中的遷移速度更快,因此比較大的分子遷移速度更慢,因此遷移距離更短,因此較大的分子可以遷移。結果,分子按大小分開(kāi)。
凝膠電泳和DNA
電泳使您能夠區分不同長(cháng)度的DNA片段。
DNA帶負電,因此,當電流施加到凝膠上時(shí),DNA會(huì )向帶正電的電極遷移。
較短的DNA鏈比較長(cháng)的DNA鏈穿過(guò)凝膠的速度更快,從而導致片段按大小順序排列。
使用染料,發(fā)熒光?標簽還是放射性的?標記使分離后的凝膠上的DNA可見(jiàn)。它們將在凝膠上顯示為條帶。
具有已知長(cháng)度片段的DNA標記通常與樣品同時(shí)在凝膠中穿行。
通過(guò)將DNA樣品的條帶與DNA標記的條帶進(jìn)行比較,可以算出樣品中DNA片段的大致長(cháng)度。
凝膠電泳如何進(jìn)行?
準備凝膠
瓊脂糖凝膠?通常用于可視化DNA片段。用于制作凝膠的瓊脂糖濃度取決于您正在使用的DNA片段的大小。
瓊脂糖濃度越高,基質(zhì)越致密,反之亦然。較小的DNA片段在較高濃度的瓊脂糖上分離,而較大的分子需要較低濃度的瓊脂糖。
為了制備凝膠,將瓊脂糖粉與電泳緩沖液混合并加熱至高溫,直到所有瓊脂糖粉融化為止。
然后將熔化的凝膠倒入凝膠澆鑄盤(pán)中,并在一端放置一個(gè)“梳子”,以制成用于移液的孔。
凝膠冷卻并固化后(現在將是不透明而不是透明的),將梳子移開(kāi)。
現在,許多人都使用預制的凝膠。
然后將凝膠放入電泳槽中,并將電泳緩沖液倒入槽中,直到覆蓋凝膠表面為止。緩沖器傳導電流。所用緩沖液的類(lèi)型取決于樣品中DNA片段的大致大小。
準備用于電泳的DNA
在電泳之前將染料添加到DNA樣品中,以增加樣品的粘度,這將防止其浮出孔,從而可以看到樣品通過(guò)凝膠的遷移。
將DNA標記物(也稱(chēng)為大小標準品或DNA階梯)裝入凝膠的**個(gè)孔中。標記中的片段長(cháng)度已知,因此可用于幫助估計樣品中片段的大小。
然后將制備的DNA樣品吸移到凝膠的其余孔中。
完成此操作后,將蓋子放在電泳槽上,確保凝膠以及正負電極的方向正確(我們希望DNA跨凝膠遷移至正端)。
分離碎片
然后打開(kāi)電流,使帶負電荷的DNA穿過(guò)凝膠向凝膠的正側移動(dòng)。
較短長(cháng)度的DNA移動(dòng)的速度快于較長(cháng)長(cháng)度的DNA,因此在運行電流時(shí)移動(dòng)的距離更遠。
DNA遷移到凝膠中的距離可以通過(guò)監視上樣緩沖液染料的遷移來(lái)直觀(guān)判斷。
留下的電流要足夠長(cháng),以確保DNA片段在凝膠上移動(dòng)的距離足以將它們分開(kāi),但不要過(guò)長(cháng)以至于它們從凝膠末端流出。
用于按大小分離DNA片段的DNA電泳設備插圖。凝膠位于緩沖罐中。將DNA樣品置于凝膠一端的孔中,并且電流流過(guò)凝膠。帶負電荷的DNA向正電極移動(dòng)。圖片來(lái)源:Genome Research Limited
可視化結果
一旦DNA在凝膠上遷移足夠遠,就將電流切斷,并將凝膠從電泳槽中移出。
為了使DNA可視化,用與DNA結合的熒光染料對凝膠進(jìn)行染色,然后將其放在紫外透射儀上,該透射儀將被染色的DNA顯示為亮帶。
或者,染料可以在倒入之前與凝膠混合。
如果凝膠正確運行,將可見(jiàn)DNA標記物/大小標準品的條帶模式。
然后可以通過(guò)想象一條橫穿DNA標記帶的水平線(xiàn)來(lái)判斷樣品中DNA的大小。然后,您可以通過(guò)將它們與標記中**接近的條帶進(jìn)行匹配來(lái)估計樣品中DNA的大小。
顯示脫氧核糖核酸帶的例證在凝膠分離了。將DNA片段的長(cháng)度與包含已知長(cháng)度的片段的標記進(jìn)行比較。
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